Au Centre de protonthérapie de l'Institut Paul Scherrer, plus de 2300 patientes et patients atteints de tumeurs profondes (tumeurs cérébrales, tumeurs de la base du crâne, tumeurs de la colonne vertébrale et sarcomes), venus de toute l’Europe, ont été traités aux stations Gantry. Plus de 840 d’entre eux étaient des enfants et des adolescents.
Les patients atteints de tumeurs de l'œil sont même irradiés avec des protons au CPT du PSI depuis 1984. Ainsi, avec plus de 8000 traitements de tumeurs oculaires, le PSI figure parmi les centres qui ont le plus d’expérience a l’échelle mondiale dans la lutte contre cette affection rare.